Genotipizzazione

Il genotipizzazione è il processo di laboratorio che determina quali varianti genetiche presenta un individuo — più comunemente polimorfismi a singolo nucleotide, o SNP. È la tecnologia alla base della maggior parte dei test genetici consumer e clinici, e comprenderne approssimativamente il funzionamento rende molto più facile interpretare i risultati in modo sensato.

Cos'è uno SNP?

Il DNA è composto da quattro basi nucleotidiche: adenina (A), timina (T), guanina (G) e citosina (C). Si accoppiano in modo prevedibile — A con T, e C con G — formando i pioli della doppia elica.

Un polimorfismo a singolo nucleotide è una variazione in una posizione di quella sequenza, in cui una base è sostituita da un'altra. Gli SNP sono la forma più comune di variazione genetica; il genoma umano ne contiene milioni.

La maggior parte degli SNP non ha alcun effetto. Alcuni si trovano in regioni che alterano il modo in cui una proteina viene costruita o la forza con cui un gene viene espresso — e sono proprio quelli che possono influenzare la suscettibilità alle malattie, il metabolismo dei nutrienti o la risposta ai farmaci.

Un esempio: l'anemia falciforme

L'anemia falciforme è un chiaro esempio di quanto sia importante un singolo cambiamento di base. L'emoglobina, la proteina che trasporta l'ossigeno nei globuli rossi, è costruita a partire dalle istruzioni del gene HBB. Una singola sostituzione di base cambia un amminoacido nella proteina risultante, rendendola incline ad aggregarsi. Quegli aggregati deformano i globuli rossi in una forma a falce rigida, in modo che rimangano intrappolati nei piccoli vasi e si degradino più velocemente del normale.

Una base. Un amminoacido. Una condizione per tutta la vita. La maggior parte degli SNP non ha effetti minimamente così drammatici — ed è proprio per questo che il contesto è importante quando si interpretano i risultati.

Come funziona la genotipizzazione

Il DNA viene prima estratto da un campione di saliva o di sangue. Poiché la quantità recuperata è piccola, viene amplificata — copiata molte volte — utilizzando la reazione a catena della polimerasi (PCR).

In Rightangled utilizziamo una variante chiamata KASP (PCR competitiva specifica per allele). KASP utilizza sonde marcate con fluorescenza progettate per legarsi solo quando è presente una versione specifica di uno SNP, in modo che il segnale fluorescente prodotto identifichi quale variante presenta un campione. È una piattaforma ben consolidata e ampiamente utilizzata, apprezzata per la sua precisione, convenienza e flessibilità su un gran numero di campioni.

Una distinzione importante: la genotipizzazione non è la stessa cosa della sequenziamento. La genotipizzazione controlla posizioni specifiche e preselezionate nel genoma. Il sequenziamento legge l'intera sequenza in una regione, o su tutto il genoma, e può rilevare varianti che nessuno stava cercando. La genotipizzazione è più veloce ed economica; il sequenziamento è completo. La maggior parte dei test consumer, inclusi i nostri, utilizza la genotipizzazione.

Cosa significa per i tuoi risultati

Poiché la genotipizzazione esamina un set definito di marcatori, un risultato che non mostra varianti di interesse significa che nessuno dei marcatori testati è stato trovato — non che tu non abbia alcun rischio genetico. Questo è il malinteso più comune in assoluto sui test genetici consumer, ed è importante chiarirlo.

Allo stesso modo, avere una variante associata al rischio non significa che svilupperai la condizione associata. Per le condizioni comuni, le varianti individuali solitamente spostano il rischio in modo modesto, e lo stile di vita ha solitamente un effetto maggiore.

Per cosa la genotipizzazione è realmente utile

• Identificare la suscettibilità a condizioni in cui un intervento precoce aiuta
• Comprendere come metabolizzi nutrienti come folato, B12 o caffeina
• Indicare la probabile risposta a determinati farmaci
• Fornire un contesto che motiva cambiamenti pratici nello stile di vita

Quando si sospetta clinicamente una specifica condizione ereditaria, i servizi genetici del NHS — con test di grado diagnostico e consulenza genetica — rimangono la via appropriata.

Test con Rightangled

I test del DNA di Rightangled utilizzano metodi di genotipizzazione validati, con risultati revisionati dal nostro team clinico, che include prescrittori indipendenti registrati presso il GPhC, e supervisione medica da parte del nostro medico, il Dr Abdullah. I nostri test del sangue completano questo misurando cosa sta accadendo nel tuo corpo in questo momento.

Verificala presso il General Pharmaceutical Council (registrazione 9011933), consulta la nostra certificazione LegitScript, e leggi le recensioni su Trustpilot.

Letture correlate: cosa sono i geni?

Questo articolo è a scopo puramente informativo e non sostituisce il parere medico personalizzato.